Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms