Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rnf180Q3U827 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf180Q3U827 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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