Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms