Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms