Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ctdnep1Q3TP92 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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