Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms