Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms