Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms