Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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RubcnlQ3TD16 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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RubcnlQ3TD16 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms