Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem104Q3TB48 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms