Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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