Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms