Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps8Q0P5W1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms