Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms