Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms