Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms