Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms