Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms