Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb4Q02738 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms