Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GscQ02591 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GscQ02591 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GscQ02591 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GscQ02591 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GscQ02591 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GscQ02591 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GscQ02591 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GscQ02591 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GscQ02591 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GscQ02591 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms