Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms