Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms