Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms