Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeleQ00690 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
SeleQ00690 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms