Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms