Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama4P97927 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms