Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gfra1P97785 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms