Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme1P97371 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme1P97371 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms