Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx2P81066 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms