Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms