Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms