Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SeboxP70368 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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