Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps3P62908 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps3P62908 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms