Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gnb1P62874 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms