Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms