Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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