Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmtd1P59913 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms