Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csrnp1P59054 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms