Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P58686 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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