Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FusP56959 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FusP56959 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FusP56959 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FusP56959 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FusP56959 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FusP56959 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FusP56959 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FusP56959 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FusP56959 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FusP56959 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FusP56959 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FusP56959 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FusP56959 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms