Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmoP56726 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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