Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms