Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms