Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PctpP53808 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PctpP53808 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PctpP53808 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PctpP53808 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PctpP53808 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PctpP53808 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PctpP53808 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PctpP53808 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PctpP53808 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PctpP53808 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PctpP53808 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms