Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MipP51180 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MipP51180 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MipP51180 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MipP51180 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MipP51180 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MipP51180 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MipP51180 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MipP51180 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MipP51180 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MipP51180 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MipP51180 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MipP51180 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MipP51180 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms