Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BckdhaP50136 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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