Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms