Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms