Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms