Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdf5P43027 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms